jacoco-0.8.4以降で"jacoco agent library failed to init instrument"が出て動かなくなりました。
で、調べたところWindows環境ではjava agentのjarへのパスをクォートで囲む必要があるようです。これまで不要だったのに何故…？
まあとにかく、
-javaagent:C:/Users/abc/spring-instrument.jar
のような引数を
-javaagent:"C:/Users/abc/spring-instrument.jar"
にしたら動くようになりました。